O IGEN foi fundado no ano de 2000, mas suas raízes remontam ao início em 1981 quando sua diretora, Profa. Dra. Maria Gerbase de Lima, tornou-se responsável pelo Laboratório de Histocompatibilidade da Disciplina de Imunologia da UNIFESP, logo após seu retorno do pós-doutorado na Universidade de Paris, no Serviço do Prof. Jean Dausset, agraciado com o Prêmio Nobel em 1980. Este pós-doutorado foi fundamental não apenas para a formação técnica e científica, como também para inserção na comunidade científica internacional de Histocompatibilidade e Imunogenética, uma tradição que continua presente no IGEN.

O IGEN é uma das filiais da AFIP – Associação Fundo de Incentivo à Pesquisa, instituição privada, filantrópica e sem fins lucrativos.

Durante seus 20 anos de existência, o IGEN apresentou um extraordinário crescimento em suas atividades, sempre pautado pela busca de excelência e melhor atendimento aos clientes.

O IGEN está sediado em um imóvel com área de 1200 m2, conta com cerca de 80 colaboradores, está equipado com os mais modernos equipamentos e conta com pessoal treinado para realizar todos os exames de histocompatibilidade com alta qualidade e presteza.